SCP的人员编级分为A级，B级，C级，D级，E级。
A级人员是那些被视为对SCP战略性行动必不可少的人员，并在任何情况下都不允许直接接触异常。当情况需要A级人员直接接近此类异常，A级人员也不被允许进入收容此类异常的设施区域并一直呆在安全区域内。若发生紧急情况，A级人员应马上疏散到一个指定的和安全的site外位置。O5议会成员一直是A级人员。
B级人员被认为对于基金会的局部行动是必不可少的，并只能接触那些经过了检疫的，或清除了任何潜在意志影响或模因媒介的项目，个体和异常。若发生收容失效或敌对势力攻击基金会设施的情况，B级人员应尽快被疏散到一个指定的，安全的site外位置。
C级人员可以直接接触大部分被认为不是太有敌意或威胁的异常。C级人员可能会直接接触潜在的意志影响或模因媒介，安全人员在认为有必要时应让其接受强制隔离或精神评估。若发生收容失效或敌对势力攻击基金会设施的情况，非战斗C级人员应马上到安全的锁定区域报到，若发生site级收容失效或其他灾害事件，则应在site安全人员的指示下撤出。
D级人员是可消耗人员，负责直接操作极端危险异常并不被允许接触A级和B级人员。D级人员通常来自全世界的监狱里的有暴力犯罪背景的囚犯，特别是那些被判死刑的。（但也有例外）在紧急情况下，可以通过Site主任的同意，允许从各监狱挑选足够资格的人成为D级人员（从某种意义上来讲这些可怜的家伙并不幸运）。D级人员应在site保安或医疗人员的指导下进行例行强制精神评估并实行一次至少B级强度的记忆消除。在site发生灾害事件的情况下，site安全人员可在其认为有必要的情况下立即处决D级人员。
最初认为使用D来称呼是因为“D指代Disposable（一次性，可处理的）”，D级人员是基金会最长和最有争议的一项传统。当第一次构思时，D级人员被建议每月末处决；不过很难想象即使将全世界的死囚都收集过来编号成D级人员也不够SCP来如此浪费人命。
自那之后，SCP的高级成员经常与D级人员打趣呢，吓唬他们不好好干活就月末处刑。虽然大部分D级成员知道这不过是一句笑话罢了，不过他们还是会装出一副惊恐的表情，让对方以为自己被吓住了。
实际上D级人员除了每月的强制精神评估与记忆消除以为，其他方面与C级人员差不了多少，每天过着国家公务员一样的生活，虽说可能会与一些可怕的SCP直接接触，不过这对这些大多数是死刑犯进来的D级人员来说已经很满意了。
据说只要表现优异，D级人员可以由Site主任报告05议会，由议会同意后升级为C级人员或消除记忆后拿上一大笔酬金回归人类社会。
E级是一个临时编级，一般不是SCP组织成员，属于特邀成员。E级成员的等级权限不定，有些可能只能翻看0级资料，而有些甚至可以翻阅5级资料。一般的E级成员如果受到SCP的异常影响，则必须接受SCP基金会的隔离，监视，检查。在确认没有潜在有害影响之后，强制加入SCP基金会，加入SCP基金会的等级由Site主任或部门管理来确定。这也是SCP基金会补充人员的一种方式，经常以各种理由邀请（忽悠）专家来参加有关“超能力收容物”的异常事件，然后让其加入（拐卖）进SCP。（虽说比较悲惨，不过生活过的比D级人员好多，至少没有每月强制性的精神鉴定与记忆清除，也比D级成员自由的多）
SCP的保密等级则分为六级，分别是。
0级（仅限公开信息）
0级安全权限被授予不需要知晓有关SCP收容下的异常项目或个体的信息的非核心人员。0级权限通常授予设施内那些无法接触操作数据的文书，后勤，或清洁岗位的人员。（也就是说D级人员与扫地阿姨都可以看到的资料）
1级（基本信任）
1级安全权限被授予那些工作接近收容下的异常物品或个体，但不直接，间接，或在信息上接触它们的人员。1级安全权限通常授予那些有收容能力或必须操作敏感信息的设施内的文书，后勤，或清洁岗位上的人员。（基本上大部分D级人员与扫地阿姨都可以查阅的资料）
2级（受限）
2级安全权限被授予那些需要直接接触有关收容中的异常项目和个体的保安和研究人员。大部分研究员，外勤特工，和收容专家都持有2级安全权限。（到这种保密文件基本上与D级人员和保洁阿姨无缘了，C级人员可以翻阅）
3级（机密）
3级安全权限授予需要深度接触有关收容中异常项目和个体的来源，回收环境和长期计划等信息的高级保安和研究人员。大部分高级研究人员，计划主管，保安官，反应小组成员，和机动特遣队作业员持有3级安全权限。（一般为B级及以上人员可以翻阅）
4级（顶级机密)
4级安全权限授予需要接触有关基金会行动和研究计划的site级和/或地区情报以及长期战略数据的高级管理人员。4级安全权限通常被Site主任，保安主任，或机动特遣队指挥官所持有。（只有A级人员可以翻阅）
5级(双子神/Thaumiel)
5级安全权限授予基金会内的最高等级管理人员，可以随意访问所有战略和其他敏感数据。5级安全权限通常只授予O5议会成员。
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